Команда ученых из России, Китая, США и Швейцарии использовала в работе новый вид биомаркеров — молекулярные пути, которые помогли проследить за развитием рака кожи: от нормального состояния к злокачественной опухоли. На их основе ученые создали систему диагностики меланомы на ранних стадиях.
Статья исследователей =6394&path[]=17515″]опубликована в журнале Oncotarget. Подробности работы приводит пресс-служба Института биоорганической химии имени академиков Шемякина и Овчинникова РАН.
Меланома — один из видов рака кожи, который образует вторичные опухоли (метастазы) и отвечает за 80% всех летальных исходов при этом виде рака.
Иммуногистохимия считается одним из самых точных методов диагностики, позволяющих выявлять патологически измененные белки, связанные с развитием рака. Но таким способом можно исследовать сравнительно небольшое количество белковых маркеров. В новом исследовании ученые нашли способ анализировать сразу несколько тысяч.
«Мы исследовали новый тип биомаркеров — молекулярные пути. При помощи таких путей, метаболических и сигнальных, идет процесс регуляции всех основных взаимодействий внутри клетки, в том числе и развитие злокачественных опухолей, — объяснил один из авторов статьи Антон Буздин. — Мы анализировали активность этих путей, чтобы детально исследовать различия и возможный переход от доброкачественной опухоли, то есть от обычной родинки, к злокачественной, то есть к первичной меланоме, и далее — к метастатической опухоли».
Ученые отобрали около 500 образцов меланомы, родинок и нормальной кожи. Данные по активности генов обрабатывали при помощи разработанной ранее тем же коллективом программы OncoFinder. Программа помогла количественно измерить активность множества молекулярных путей в образцах. Это дало возможность определить «следы» различных форм меланомы.
«В результате анализа мы обнаружили молекулярные пути, которые отлично маркируют переход от нормального состояния клеток к родинке, а затем — к меланоме. Выяснилось, что процессы могут различаться: для меланомы, образующейся из клеток родинки, они одни, а для меланомы из нормальных клеток кожи — другие, — говорит Антон Буздин. — Причем мы узнали, что молекулярные пути обладают множеством неизвестных ранее случаев совместной регуляции. Это значит, что они объединяются в более широкие регуляторно-метаболические сети».
По словам авторов, полученные данные помогут выявить уязвимые места опухоли на молекулярном уровне, а значит, позволят подобрать новые способы для борьбы с меланомой.
Ранее международная команда ученых выяснила, какие мутации отвечают за формирование еще одного, самого распространенного вида рака кожи — базальноклеточной карциномы.
Иллюстрация к статье:
Обсуждение